宋朝時期屬晉江縣晉江鄉棠陰里、愛育里;元、明、清朝時期屬晉江縣三十八都泉山埔;民國時期屬晉江縣東北鄉清源保;1949年屬晉江縣第三區清源鄉;1958年從晉江縣析出,歸泉州市管轄,置北峰公社清源農場、泉州共青團農莊、清源茶果社;1959年將三者合并,成立泉州市亞熱帶作物試驗場;1960改稱清源農場;1961年改為泉州市清源農場第六管區;1999年8月8日設泉州市清源街道清源村民委員會;2003年改為泉州市清源街道清源社區居民委員會。