全境原屬巴縣。
1939年，石橋鋪、楊家坪等劃入重慶市。
1950年10月，以舊第八區、十七區合并組建重慶市第四區，區人民政府駐大坪。
1952年，化龍橋、大坪、歇臺子、石橋鋪、黃沙溪、遺愛祠6街道和石橋、黃泥、歇臺3鄉劃出，李家沱、土橋、馬桑溪（茄子溪）3街道和南泉、花溪、建勝、八橋等鄉劃入，區人民政府駐地遷至李家沱。
1955年，以境內長江段有“九石翹首若龍”（乾隆《巴縣志》）的九龍灘定名重慶市九龍坡區。
1965年，九宮廟、新山村、躍進村3街道劃出建大渡口區。
1988年，區人民政府駐地遷至楊家坪。
1995年，李家沱、南泉、建勝等劃出，原巴縣白市驛、含谷、走馬、金鳳、陶家、巴福、西彭、銅罐驛8鎮和石板鄉，沙坪壩區石橋鋪街道、石橋鎮劃入。