北宋乾德三年（965年），置云門鎮，屬合州石照縣。
清雍正六年（1728年），屬合州明月里。
民國二十年（1931年），屬第五區。
民國二十一年（1932年），屬第三區，為區公所駐地。
民國二十八年（1939年），云門鎮與渠嘉鄉合并設云渠鎮。
民國三十年（1941年），云渠鎮析設渠嘉鄉，復為云門鎮。
1949年12月下旬，屬第四區，為區公所駐地。
1952年7月，云門鎮析設建設、涼水鄉。
1956年1月，建設、涼水鄉合并成立云門鄉。
1958年9月，云門鎮與云門鄉合并建云門公社。
1965年3月，云門公社析置云門鎮。
1968年，云門公社改名衛東公社。
1972年，恢復云門公社原名。
1983年12月，云門公社改為云門鄉。
1985年2月，云門鄉并入云門鎮。
1993年12月，渠嘉鄉并入云門鎮。
2001年6月，天星鎮并入云門鎮。
2005年4月，高龍鎮并入云門鎮。
2009年12月，撤云門鎮設云門街道。