明末清初，屬北岸水里。
清朝時期，屬第二區溪字鄉。
民國八年（1919年），屬東溪總團。
民國十九年（1930年），屬第二區溪字鄉。
民國二十二年（1933年），改屬第一區。
民國二十四年（1935年），屬溪字聯保。
民國二十五年（1936年），改為東溪聯保。
民國二十九年（1940年），實行新縣制，屬指導（第一）區東溪鄉。
民國三十年（1941年），屬天池鄉。
1953年2月，從天池鄉分出設巖灣鄉。
1958年11月，巖灣鄉撤鄉建社，為巖灣公社。
1983年，巖灣公社改為巖灣鄉。
1992年9月，撤巖灣鄉，屬汾河鎮。
1999年10月，由汾河鎮析置巖灣鄉。